這時蔣經國 44年(1955)出任「國防會議」副秘書長,已逐漸掌握黨、政、軍、特,接班態勢甚明。
52年(1963)蔣介石77歲為幫助蔣經國,他讓陳誠辭去行政院長並以三級跳培養接班。
53年(1964)讓蔣經國以行政院政務委員兼任國防部副部長。
54年(1965)接任國防部長,這時被認為會妨礙「太子」蔣經國接班的陳誠癌症病逝。無人可與爭峰,
56年(1967)委以「國家安全會議」國家總動員委員會主任委員。
57年(1968)為鞏固領導權,消除民間雜音,及可能藉選舉產生的反抗勢力,將臺北市改為「直轄市」,市長由總統任命,實際則讓親信張豐緒擔任。
58年(1969)蔣經國出任行政院副院長。
蔣介石年歲已高,接任在即的蔣經國有必要拜訪美、日政要,
59年(1970)蔣經國赴美訪問,在紐約為臺獨聯盟成員黃文雄、鄭自財刺殺未成,成為世界轟動消息,打破美國人民從麥卡錫以來,一直相信臺灣是「自由中國」面目。因此緣故,美國國會議員佛列撤在眾議院發表「『自由中國』的政治壓抑」演講,將臺灣以特務統治公諸於世,這篇以「『自由中國』既不自由,亦非中國」為結論的國會報告,終成為美國日後對臺政策的基本架構(一一九213頁)。
美國內雖有此批評,但對實權在握的蔣介石已無法左右,
61年(1972)蔣經國終成為行政院長,雖末登上總統寶座,整個臺灣已成禁臠,當時蔣介石已 86歲。
56年(1967)在蔣介石老邁,實際掌握權力的蔣經國開始他的施政作為。
首先,56年(1967)以「國家安全會議」名義,要求將原本六年的義務教育改為九年,且從 57年(1968) 9月開始實施。當時教室、資金和師資等都極缺乏,財政部長俞國華受命籌措,他從中美基金撥出部份款項,下猛藥調高稅金,調高田賦、營業稅、貨物稅、加徵教育捐等解決財政困窘。